蜂蜜中的葡萄糖结晶核非常细小，存在于花蜜中和贮存过蜂蜜的旧巢牌中。在一定的条件下蜂蜜中的葡萄糖就围绕这些细小的晶核长大结晶。蜂蜜内含有的结晶核越多，结晶的速度就越快。
蜂蜜结晶速度的快慢也受温度的影响在13—14℃时最易结晶。若低于此温度，由于蜂蜜的粘调度提高，致使蜂蜜结晶迟缓；若高于此温度，由于提高了糖的溶解度，从而减少了溶液的过饱和程度，也使结晶变慢。因此我们在保存蜂蜜的过程中，就要控制好温度以延续蜂蜜结晶的进程。
蜂蜜的结晶还与蜂蜜的种类、含水量有关。如紫云英蜜、洋槐蜜、枣花蜜则不易结晶、而油菜蜜、棉花蜜、向日葵就易于结晶。全部结晶的蜂蜜，一般含水量较低，宜长期保存不易变质。含水量多的未成熟蜂蜜，由于溶液的过饱和程度降低，结晶速度也会变慢或不能全部结晶、使结晶的葡萄糖沉到底部，其他稀薄的蜂蜜浮在上层，这种半结晶的蜂蜜其营养成份也未发生变化，只是未结晶蜂蜜含水量相应增加，因此这种蜂蜜不宜长期保存，应及时食用。
如果要把结晶的蜂蜜融化开，可以把装蜂蜜的罐子放进开水锅里加热，不可把蜂蜜直接放到火上烧烤。值得注意的是，当蜂蜜被加热到37℃-40℃时，就会丧失它的治疗功效，因此注意不要热得过火。
食用的蜂蜜，一定要选购成熟发蜂蜜。蜂蜜是一种弱酸性食品。存放蜂蜜的容器最好用玻璃或陶瓷器皿储存，以免游离重金属污染蜂蜜。用无毒塑料瓶存放的蜂蜜，时间也不宜过长。装入容器的蜂蜜，最好加盖密封，避免与潮湿的空气接触，以免发酵，应放在清洁、阴凉通风的地方，最好放在冰箱里保存，注意避免污染。
注意事项
蜂蜜的保存期目前国家规定瓶装蜜保质期18个月。但封盖成熟浓度高的蜂也能保质多年。但吃蜂蜜新鲜为好，因新鲜蜜一般色、香、味口感较好。
