排卵障碍是指不能排出正常的。包括完全没有排卵、很少排卵或是不规则排卵。但仍有少量病例在全面检查后仍然找不到解释原因。排卵障碍最常见的原因是某种激素缺乏，如果卵巢本身对正常水平的激素有抵抗，即无反应，也可引起排卵障碍。此外，卵巢缺失、损伤或疾病都可阻碍排卵。引起排卵障碍的原因很多。
以下介绍的仅是临床上常见的几种疾病。
卵巢功能障碍导致不排卵的常见疾病为卵巢早衰。医学上把40岁以前绝经的患者称为卵巢早衰。患者早期正常，甚至有生育史，但随后稀发，直至完全闭经。病因尚不清楚。这类患者卵巢内的卵泡已消耗竭完，不可能再用促排卵物使卵泡发育，或虽有原始卵泡，但对无反应。俗话说的好“巧妇难为无米之炊”。这一类排卵障碍的的患者，要想生育只能借别人的作试管婴儿才可能达到怀孕的目的。
多囊卵巢综合征也是一种常见的排卵障碍。其病因比较复杂，至今仍是医学界研究的热点。临床表现形式也多种多样。除了不排卵导致闭经或外，还可能出现多毛、肥胖、痤疮等体征。其卵巢的特点是巢体积增大，有多个但却不能发育成熟，因此需要用物来促卵泡发育诱发排卵。有研究认为多囊卵巢综合征患者有家族史，对某些患者进行家谱分析也可看到有遗传倾向。目前有待进一步研究。
垂体问题导致排卵障碍的常见疾病有高泌乳素血症、垂体泌乳素瘤和希罕氏综合征等。高催乳素水平可抑制排卵。如果激素测定显示泌乳素增高，首先要根据泌乳素增高的程度作进一步检查，弄清有无垂体泌乳素瘤，如果因垂体瘤引起闭经泌乳，则应根据瘤体大小决定是否手术或物治疗。溴隐停是目前治疗高泌乳素血症的有效物。高泌乳素血症的患者经治疗后，泌乳素可降至正常，排卵恢复，妊娠率很高，但应在医生的指导下用。希罕氏综合征是指由于产后大出血引起的垂体前叶缺血或栓塞造成缺血性坏死，垂体功能低下，导致排卵障碍，同时伴有甲状腺和肾上腺等多个内分泌腺体的功能低下。治疗这类排卵障碍的有效方法是应用诱导排卵。
下丘脑功能障碍导致不排卵是由于下丘脑的输入信号不正常而导致释放激素减少。包括紧张、精神性厌食、单纯体重下降性闭经和运动量过大导致闭经等。盼子心切、精神紧张也可导致内分泌的障碍；全身严重的消耗性疾病或营养不良也可致无排卵和闭经。这一类排卵障碍的治疗涉及精神治疗和生活方式的调整，使其恢复下丘脑－垂体－卵巢的功能。因其低性腺激素的特点，所以对要求生育者可应用治疗来诱发排卵。
